Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01757 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01757 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01757 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01757 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01757 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01757 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01757 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01757 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01757 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01757 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01757 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01757 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01757 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01757 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01757 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01757 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01757 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01757 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01757 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01757 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01757 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01757 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01757 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01757 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01757 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01757 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01757 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01757 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01757 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01757 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01757 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01757 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01757 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01757 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01757 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01757 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01757 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01757 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01757 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01757 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01757 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01757 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01757 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01757 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01757 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01757 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01757 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01757 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01757 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01757 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01757 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01757 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01757 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01757 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01757 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01757 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01757 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01757 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01757 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms