Protein–RNA interactions for Protein: P01756

Ig heavy chain V region MOPC 104E, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01756 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01756 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01756 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01756 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01756 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01756 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01756 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01756 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01756 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01756 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01756 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01756 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01756 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01756 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01756 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01756 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01756 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01756 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01756 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01756 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01756 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01756 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01756 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01756 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01756 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01756 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01756 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01756 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01756 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01756 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01756 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01756 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01756 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01756 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01756 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01756 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01756 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01756 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01756 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01756 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01756 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01756 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01756 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01756 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01756 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01756 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01756 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01756 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01756 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01756 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01756 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01756 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01756 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01756 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01756 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01756 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01756 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01756 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01756 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01756 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.7 ms