Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01741 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01741 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01741 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01741 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01741 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01741 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01741 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01741 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01741 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01741 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01741 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01741 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01741 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01741 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01741 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01741 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01741 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01741 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms