Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01740 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01740 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01740 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01740 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P01740 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01740 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01740 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01740 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01740 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01740 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01740 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P01740 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01740 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01740 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01740 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01740 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01740 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01740 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P01740 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01740 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01740 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P01740 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01740 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01740 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01740 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01740 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01740 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01740 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01740 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01740 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01740 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01740 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01740 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01740 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01740 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01740 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01740 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01740 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P01740 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01740 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01740 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01740 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01740 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01740 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01740 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01740 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01740 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01740 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P01740 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01740 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01740 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01740 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01740 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01740 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01740 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01740 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01740 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01740 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01740 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01740 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01740 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01740 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1265.4 ms