Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01673 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01673 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01673 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01673 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01673 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01673 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01673 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01673 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01673 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01673 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01673 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01673 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01673 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01673 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01673 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01673 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01673 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01673 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01673 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01673 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P01673 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01673 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01673 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01673 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01673 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01673 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01673 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01673 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01673 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01673 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01673 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01673 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01673 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01673 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01673 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01673 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01673 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01673 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01673 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01673 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01673 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01673 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01673 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01673 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01673 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01673 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01673 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01673 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01673 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01673 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01673 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01673 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01673 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01673 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01673 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01673 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01673 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01673 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01673 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01673 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01673 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01673 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01673 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01673 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.4 ms