Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Igk-V19-17P01633 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igk-V19-17P01633 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igk-V19-17P01633 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms