Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mtatp6P00848 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtatp6P00848 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mtatp6P00848 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mtatp6P00848 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms