Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hcn2O88703 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hcn2O88703 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hcn2O88703 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hcn2O88703 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms