Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cops6O88545 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cops6O88545 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cops6O88545 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cops6O88545 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cops6O88545 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cops6O88545 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cops6O88545 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Cops6O88545 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cops6O88545 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cops6O88545 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cops6O88545 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cops6O88545 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cops6O88545 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cops6O88545 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cops6O88545 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cops6O88545 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cops6O88545 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cops6O88545 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cops6O88545 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cops6O88545 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cops6O88545 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cops6O88545 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cops6O88545 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cops6O88545 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cops6O88545 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cops6O88545 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cops6O88545 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cops6O88545 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cops6O88545 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cops6O88545 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cops6O88545 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cops6O88545 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops6O88545 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cops6O88545 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cops6O88545 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cops6O88545 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cops6O88545 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms