Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfrO88507 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfrO88507 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CntfrO88507 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CntfrO88507 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfrO88507 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfrO88507 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfrO88507 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms