Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdh7O88451 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh7O88451 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh7O88451 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rdh7O88451 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh7O88451 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms