Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IkbkbO88351 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IkbkbO88351 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IkbkbO88351 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IkbkbO88351 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms