Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mid1O70583 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mid1O70583 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mid1O70583 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mid1O70583 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mid1O70583 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid1O70583 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid1O70583 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid1O70583 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid1O70583 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid1O70583 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid1O70583 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms