Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smpd2O70572 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpd2O70572 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd2O70572 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd2O70572 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms