Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srpk1O70551 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srpk1O70551 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms