Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap2O55126 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nipsnap2O55126 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap2O55126 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap2O55126 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms