Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SlkO54988 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SlkO54988 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SlkO54988 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SlkO54988 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SlkO54988 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SlkO54988 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SlkO54988 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SlkO54988 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SlkO54988 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SlkO54988 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SlkO54988 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SlkO54988 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SlkO54988 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SlkO54988 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SlkO54988 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SlkO54988 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SlkO54988 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SlkO54988 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SlkO54988 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SlkO54988 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SlkO54988 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SlkO54988 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SlkO54988 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SlkO54988 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SlkO54988 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SlkO54988 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SlkO54988 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SlkO54988 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SlkO54988 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SlkO54988 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SlkO54988 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SlkO54988 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SlkO54988 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SlkO54988 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SlkO54988 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SlkO54988 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SlkO54988 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SlkO54988 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SlkO54988 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SlkO54988 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SlkO54988 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SlkO54988 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SlkO54988 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SlkO54988 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SlkO54988 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SlkO54988 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SlkO54988 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SlkO54988 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SlkO54988 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SlkO54988 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SlkO54988 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SlkO54988 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SlkO54988 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SlkO54988 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SlkO54988 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SlkO54988 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SlkO54988 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SlkO54988 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SlkO54988 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SlkO54988 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SlkO54988 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SlkO54988 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SlkO54988 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SlkO54988 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SlkO54988 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SlkO54988 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SlkO54988 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SlkO54988 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SlkO54988 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SlkO54988 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SlkO54988 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SlkO54988 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SlkO54988 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SlkO54988 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SlkO54988 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SlkO54988 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SlkO54988 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SlkO54988 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SlkO54988 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SlkO54988 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms