Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole2O54956 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pole2O54956 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pole2O54956 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole2O54956 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pole2O54956 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pole2O54956 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pole2O54956 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pole2O54956 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms