Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16O54909 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh16O54909 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16O54909 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms