Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3cdO35904 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cdO35904 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3cdO35904 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms