Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops5O35864 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cops5O35864 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops5O35864 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cops5O35864 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cops5O35864 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cops5O35864 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops5O35864 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops5O35864 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cops5O35864 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cops5O35864 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops5O35864 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cops5O35864 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops5O35864 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cops5O35864 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms