Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NudcO35685 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NudcO35685 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NudcO35685 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NudcO35685 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NudcO35685 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NudcO35685 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NudcO35685 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NudcO35685 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NudcO35685 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NudcO35685 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NudcO35685 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NudcO35685 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NudcO35685 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NudcO35685 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NudcO35685 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NudcO35685 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NudcO35685 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NudcO35685 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NudcO35685 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NudcO35685 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NudcO35685 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NudcO35685 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NudcO35685 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NudcO35685 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NudcO35685 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NudcO35685 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NudcO35685 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NudcO35685 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NudcO35685 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NudcO35685 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NudcO35685 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NudcO35685 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NudcO35685 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NudcO35685 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NudcO35685 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NudcO35685 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NudcO35685 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NudcO35685 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NudcO35685 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NudcO35685 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NudcO35685 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NudcO35685 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NudcO35685 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NudcO35685 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NudcO35685 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NudcO35685 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NudcO35685 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NudcO35685 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NudcO35685 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NudcO35685 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NudcO35685 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NudcO35685 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NudcO35685 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NudcO35685 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NudcO35685 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NudcO35685 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NudcO35685 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NudcO35685 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NudcO35685 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NudcO35685 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NudcO35685 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NudcO35685 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NudcO35685 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NudcO35685 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NudcO35685 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NudcO35685 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NudcO35685 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NudcO35685 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NudcO35685 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NudcO35685 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NudcO35685 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NudcO35685 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NudcO35685 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NudcO35685 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NudcO35685 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NudcO35685 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NudcO35685 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NudcO35685 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NudcO35685 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NudcO35685 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NudcO35685 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NudcO35685 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NudcO35685 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NudcO35685 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NudcO35685 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NudcO35685 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NudcO35685 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NudcO35685 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NudcO35685 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NudcO35685 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NudcO35685 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NudcO35685 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NudcO35685 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NudcO35685 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NudcO35685 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NudcO35685 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NudcO35685 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NudcO35685 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NudcO35685 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms