Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifnar2O35664 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ifnar2O35664 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnar2O35664 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnar2O35664 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnar2O35664 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar2O35664 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar2O35664 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar2O35664 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar2O35664 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnar2O35664 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms