Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp3O35609 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp3O35609 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp3O35609 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp3O35609 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms