Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnxbO35452 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TnxbO35452 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnxbO35452 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TnxbO35452 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TnxbO35452 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TnxbO35452 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms