Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CrcpO35427 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CrcpO35427 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CrcpO35427 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CrcpO35427 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CrcpO35427 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CrcpO35427 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CrcpO35427 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CrcpO35427 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CrcpO35427 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CrcpO35427 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CrcpO35427 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CrcpO35427 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CrcpO35427 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrcpO35427 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms