Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Xbp1O35426 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xbp1O35426 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xbp1O35426 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms