Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfrsf11aO35305 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf11aO35305 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf11aO35305 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf11aO35305 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms