Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc23O35125 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc23O35125 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc23O35125 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms