Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema3aO08665 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3aO08665 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3aO08665 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3aO08665 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms