Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U90926O08546 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
U90926O08546 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
U90926O08546 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
U90926O08546 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U90926O08546 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U90926O08546 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
U90926O08546 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
U90926O08546 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
U90926O08546 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U90926O08546 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U90926O08546 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U90926O08546 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U90926O08546 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U90926O08546 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U90926O08546 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U90926O08546 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U90926O08546 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U90926O08546 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U90926O08546 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U90926O08546 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U90926O08546 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U90926O08546 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U90926O08546 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U90926O08546 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U90926O08546 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U90926O08546 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U90926O08546 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
U90926O08546 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms