Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc191J3QQ27 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc191J3QQ27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc191J3QQ27 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms