Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn34c2J3QNM1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c2J3QNM1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c2J3QNM1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms