Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21060J3KMU4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21060J3KMU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21060J3KMU4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21060J3KMU4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms