Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r167G3UW71 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r167G3UW71 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r167G3UW71 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.5 ms