Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LctF8VPT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LctF8VPT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LctF8VPT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms