Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5160F8VPN3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm5160F8VPN3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5160F8VPN3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5160F8VPN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms