Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Crocc2F6XLV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Crocc2F6XLV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Crocc2F6XLV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Crocc2F6XLV1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Crocc2F6XLV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Crocc2F6XLV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms