Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc149F6V035 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc149F6V035 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc149F6V035 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc149F6V035 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms