Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sptbn5F6UCX4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sptbn5F6UCX4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sptbn5F6UCX4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sptbn5F6UCX4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sptbn5F6UCX4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms