Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm28374F6SG70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm28374F6SG70 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm28374F6SG70 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm28374F6SG70 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm28374F6SG70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm28374F6SG70 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm28374F6SG70 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm28374F6SG70 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28374F6SG70 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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