Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm340F6RGI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm340F6RGI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm340F6RGI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm340F6RGI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms