Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp17lbE9Q9U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp17lbE9Q9U0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp17lbE9Q9U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp17lbE9Q9U0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms