Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r238E9Q373 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r238E9Q373 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r238E9Q373 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r238E9Q373 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms