Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm3893E9Q1I1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm3893E9Q1I1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm3893E9Q1I1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm3893E9Q1I1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm3893E9Q1I1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms