Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930426L09RikE9Q0N7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
4930426L09RikE9Q0N7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930426L09RikE9Q0N7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930426L09RikE9Q0N7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms