Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm9972E9Q053 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm9972E9Q053 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm9972E9Q053 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm9972E9Q053 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms