Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcom1E9PZ54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcom1E9PZ54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gcom1E9PZ54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gcom1E9PZ54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms