Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sbf2E9PXF8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sbf2E9PXF8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sbf2E9PXF8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sbf2E9PXF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbf2E9PXF8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sbf2E9PXF8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms