Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54bE9PXC0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54bE9PXC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54bE9PXC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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